31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3345 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3345  CopG family transcriptional regulator  100 
 
 		 139 aa  279  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.217671  normal  0.29014 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4274  CopG family transcriptional regulator  71.74 
 
 		 146 aa  208  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.825562  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3868  CopG family transcriptional regulator  72.26 
 
 		 142 aa  205  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.433673  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5380  hypothetical protein  70.29 
 
 		 144 aa  204  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.948806  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6241  hypothetical protein  70.29 
 
 		 142 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7064  hypothetical protein  70.29 
 
 		 142 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108965  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1968  transcription regulator  69.29 
 
 		 142 aa  192  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0139479  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4126  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  66.42 
 
 		 139 aa  189  8e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3818  hypothetical protein  65.69 
 
 		 139 aa  188  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6024  hypothetical protein  64.23 
 
 		 139 aa  185  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0821721 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3361  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  61.15 
 
 		 139 aa  184  5e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2990  hypothetical protein  64.89 
 
 		 137 aa  174  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.483835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1484  CopG family transcriptional regulator  59.46 
 
 		 149 aa  173  9e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.080606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7172  hypothetical protein  63.43 
 
 		 135 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1485  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  63.85 
 
 		 149 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0226236  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1762  putative transcriptional regulator, CopG family  58.78 
 
 		 149 aa  171  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.292102 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4103  hypothetical protein  68.75 
 
 		 136 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.810494 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1213  putative transcriptional regulator, CopG family  60.14 
 
 		 139 aa  170  5.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.026767 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2203  CopG family transcriptional regulator  61.19 
 
 		 138 aa  169  7.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33510  transcriptional regulator  62.59 
 
 		 140 aa  167  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.543967  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1286  putative transcriptional regulators, CopG/Arc/MetJ family  65.38 
 
 		 141 aa  167  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.374792  normal  0.0477527 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2577  hypothetical protein  63.85 
 
 		 141 aa  166  7e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3269  transcription regulator  64.62 
 
 		 141 aa  165  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5707  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  63.5 
 
 		 139 aa  165  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.2517  hitchhiker  0.00354833 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3858  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  64.23 
 
 		 140 aa  158  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2066  transcriptional regulator  61.79 
 
 		 141 aa  154  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0365055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4028  hypothetical protein  65.12 
 
 		 140 aa  149  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.346056 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2649  hypothetical protein  56.56 
 
 		 139 aa  147  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.305785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1991  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  55.56 
 
 		 131 aa  140  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000140363  normal  0.0704481 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1172  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  55.65 
 
 		 131 aa  136  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1953  hypothetical protein  48.41 
 
 		 128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>