31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_7172 on replicon NC_007488
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007488  RSP_7172  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  264  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4103  hypothetical protein  80.3 
 
 
136 aa  211  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.810494 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2990  hypothetical protein  74.42 
 
 
137 aa  187  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.483835  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1968  transcription regulator  71.09 
 
 
142 aa  181  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0139479  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2203  CopG family transcriptional regulator  66.67 
 
 
138 aa  172  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5380  hypothetical protein  62.96 
 
 
144 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.948806  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3345  CopG family transcriptional regulator  63.43 
 
 
139 aa  172  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.217671  normal  0.29014 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3868  CopG family transcriptional regulator  64.62 
 
 
142 aa  169  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.433673  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4274  CopG family transcriptional regulator  63.08 
 
 
146 aa  167  4e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.825562  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7064  hypothetical protein  64.62 
 
 
142 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108965  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1213  putative transcriptional regulator, CopG family  64.34 
 
 
139 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.026767 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6241  hypothetical protein  63.08 
 
 
142 aa  157  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3269  transcription regulator  62.02 
 
 
141 aa  156  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33510  transcriptional regulator  62.6 
 
 
140 aa  155  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.543967  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4126  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  62.5 
 
 
139 aa  156  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3818  hypothetical protein  61.72 
 
 
139 aa  154  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1762  putative transcriptional regulator, CopG family  63.28 
 
 
149 aa  152  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.292102 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1286  putative transcriptional regulators, CopG/Arc/MetJ family  58.91 
 
 
141 aa  152  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.374792  normal  0.0477527 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2577  hypothetical protein  61.54 
 
 
141 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1484  CopG family transcriptional regulator  62.5 
 
 
149 aa  150  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.080606  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2066  transcriptional regulator  63.85 
 
 
141 aa  150  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0365055  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1485  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  60.47 
 
 
149 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0226236  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6024  hypothetical protein  60.16 
 
 
139 aa  150  8e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0821721 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3858  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  58.7 
 
 
140 aa  147  7e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4028  hypothetical protein  64.62 
 
 
140 aa  143  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.346056 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5707  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  58.65 
 
 
139 aa  141  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.2517  hitchhiker  0.00354833 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3361  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  56.69 
 
 
139 aa  140  5e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2649  hypothetical protein  55.65 
 
 
139 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.305785  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1991  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  61.79 
 
 
131 aa  139  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000140363  normal  0.0704481 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1172  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  57.48 
 
 
131 aa  130  6e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1953  hypothetical protein  46.03 
 
 
128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>