31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1484 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1484  CopG family transcriptional regulator  100 
 
 		 149 aa  291  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.080606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1762  putative transcriptional regulator, CopG family  97.99 
 
 		 149 aa  287  3e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.292102 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1485  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  87.84 
 
 		 149 aa  258  3e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0226236  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7064  hypothetical protein  67.57 
 
 		 142 aa  188  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108965  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6241  hypothetical protein  64.86 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4274  CopG family transcriptional regulator  61.49 
 
 		 146 aa  178  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.825562  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3868  CopG family transcriptional regulator  60.84 
 
 		 142 aa  173  6e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.433673  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3345  CopG family transcriptional regulator  59.46 
 
 		 139 aa  173  9e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.217671  normal  0.29014 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6024  hypothetical protein  61.22 
 
 		 139 aa  166  9e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0821721 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1213  putative transcriptional regulator, CopG family  59.09 
 
 		 139 aa  164  4e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.026767 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5380  hypothetical protein  61.07 
 
 		 144 aa  163  8e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.948806  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33510  transcriptional regulator  58.39 
 
 		 140 aa  158  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.543967  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1968  transcription regulator  62.99 
 
 		 142 aa  156  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0139479  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2990  hypothetical protein  59.38 
 
 		 137 aa  155  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.483835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2577  hypothetical protein  60.74 
 
 		 141 aa  155  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4126  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  57.14 
 
 		 139 aa  154  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3818  hypothetical protein  56.46 
 
 		 139 aa  152  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3361  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  55.78 
 
 		 139 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3858  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  60.94 
 
 		 140 aa  151  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7172  hypothetical protein  62.5 
 
 		 135 aa  150  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1286  putative transcriptional regulators, CopG/Arc/MetJ family  57.81 
 
 		 141 aa  148  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.374792  normal  0.0477527 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2066  transcriptional regulator  59.38 
 
 		 141 aa  148  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0365055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3269  transcription regulator  57.03 
 
 		 141 aa  146  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4103  hypothetical protein  61.6 
 
 		 136 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.810494 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2649  hypothetical protein  57.48 
 
 		 139 aa  144  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.305785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4028  hypothetical protein  62.5 
 
 		 140 aa  140  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.346056 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5707  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  64.52 
 
 		 139 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.2517  hitchhiker  0.00354833 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2203  CopG family transcriptional regulator  52.71 
 
 		 138 aa  135  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1991  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  54.1 
 
 		 131 aa  130  9e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000140363  normal  0.0704481 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1172  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  52.34 
 
 		 131 aa  127  6e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1953  hypothetical protein  41.27 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>