31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4274 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007959  Nham_4274  CopG family transcriptional regulator  100 
 
 		 146 aa  292  1e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.825562  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3868  CopG family transcriptional regulator  85.61 
 
 		 142 aa  244  3e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.433673  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5380  hypothetical protein  84.4 
 
 		 144 aa  242  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.948806  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3345  CopG family transcriptional regulator  71.74 
 
 		 139 aa  208  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.217671  normal  0.29014 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6241  hypothetical protein  71.94 
 
 		 142 aa  207  6e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7064  hypothetical protein  71.63 
 
 		 142 aa  205  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108965  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4126  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  70.07 
 
 		 139 aa  199  8e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6024  hypothetical protein  68.61 
 
 		 139 aa  197  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0821721 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3818  hypothetical protein  69.34 
 
 		 139 aa  198  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1968  transcription regulator  67.91 
 
 		 142 aa  189  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0139479  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33510  transcriptional regulator  65.71 
 
 		 140 aa  184  4e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.543967  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1762  putative transcriptional regulator, CopG family  62.84 
 
 		 149 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.292102 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1213  putative transcriptional regulator, CopG family  61.87 
 
 		 139 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.026767 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3361  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  64.23 
 
 		 139 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1484  CopG family transcriptional regulator  61.49 
 
 		 149 aa  178  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.080606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2577  hypothetical protein  68.18 
 
 		 141 aa  178  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1485  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  60.81 
 
 		 149 aa  177  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0226236  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3858  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  69.29 
 
 		 140 aa  176  7e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3269  transcription regulator  66.92 
 
 		 141 aa  176  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2649  hypothetical protein  62.96 
 
 		 139 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.305785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1286  putative transcriptional regulators, CopG/Arc/MetJ family  63.85 
 
 		 141 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.374792  normal  0.0477527 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2066  transcriptional regulator  65.35 
 
 		 141 aa  169  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0365055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2990  hypothetical protein  62.12 
 
 		 137 aa  168  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.483835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7172  hypothetical protein  63.08 
 
 		 135 aa  167  3e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5707  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  66.42 
 
 		 139 aa  167  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.2517  hitchhiker  0.00354833 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2203  CopG family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 138 aa  167  6e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4103  hypothetical protein  63.57 
 
 		 136 aa  163  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.810494 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4028  hypothetical protein  67.44 
 
 		 140 aa  159  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.346056 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1172  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  62.7 
 
 		 131 aa  149  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1991  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  56.91 
 
 		 131 aa  138  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000140363  normal  0.0704481 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1953  hypothetical protein  46.4 
 
 		 128 aa  121  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>