27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1466 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1466  hypothetical protein  100 
 
 
89 aa  169  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64047  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0792  hypothetical protein  51.14 
 
 
100 aa  94.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.576927 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0554  hypothetical protein  52.94 
 
 
101 aa  94.4  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4618  hypothetical protein  51.76 
 
 
100 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.549833  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0869  hypothetical protein  51.81 
 
 
100 aa  94  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0737512  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0463  hypothetical protein  51.76 
 
 
101 aa  92  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0752  hypothetical protein  52.94 
 
 
99 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0797  hypothetical protein  50.57 
 
 
102 aa  88.2  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.763235  hitchhiker  0.00476248 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0322  hypothetical protein  40.7 
 
 
88 aa  69.7  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.835097  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0308  hypothetical protein  40.7 
 
 
88 aa  69.7  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1070  hypothetical protein  37.08 
 
 
109 aa  68.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.215268 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3476  hypothetical protein  42.68 
 
 
122 aa  67  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.404419  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3152  hypothetical protein  42.68 
 
 
122 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.412403  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3808  hypothetical protein  39.33 
 
 
118 aa  66.6  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0320919 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0401  hypothetical protein  38.37 
 
 
88 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3348  hypothetical protein  41.46 
 
 
118 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.682693  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0196  hypothetical protein  36.05 
 
 
88 aa  64.7  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3260  hypothetical protein  41.46 
 
 
121 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.161528 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4533  hypothetical protein  40.24 
 
 
115 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.561656  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0225  hypothetical protein  32.56 
 
 
88 aa  60.1  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0451  hypothetical protein  40.45 
 
 
90 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00606209  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0541  hypothetical protein  35.71 
 
 
117 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.752321 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0589  hypothetical protein  31.4 
 
 
88 aa  58.2  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0095  hypothetical protein  34.67 
 
 
87 aa  54.3  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1035  hypothetical protein  30.59 
 
 
91 aa  51.2  0.000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.537516  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0158  hypothetical protein  40.7 
 
 
88 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.438063  normal  0.749446 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0526  hypothetical protein  36.99 
 
 
106 aa  47.8  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.613897 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>