26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0225 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0225  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  170  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0196  hypothetical protein  89.77 
 
 
88 aa  157  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0589  hypothetical protein  65.91 
 
 
88 aa  121  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0308  hypothetical protein  59.09 
 
 
88 aa  111  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0322  hypothetical protein  59.09 
 
 
88 aa  111  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.835097  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0401  hypothetical protein  57.95 
 
 
88 aa  104  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0158  hypothetical protein  68.18 
 
 
88 aa  98.6  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.438063  normal  0.749446 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0095  hypothetical protein  54.17 
 
 
87 aa  80.9  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4618  hypothetical protein  44.83 
 
 
100 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.549833  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0554  hypothetical protein  40.23 
 
 
101 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0869  hypothetical protein  43.68 
 
 
100 aa  68.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0737512  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0792  hypothetical protein  43.68 
 
 
100 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.576927 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0463  hypothetical protein  39.08 
 
 
101 aa  65.5  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0451  hypothetical protein  42.5 
 
 
90 aa  63.9  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00606209  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1035  hypothetical protein  38.82 
 
 
91 aa  63.5  0.0000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.537516  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0752  hypothetical protein  40.23 
 
 
99 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1466  hypothetical protein  32.56 
 
 
89 aa  60.1  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64047  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0797  hypothetical protein  40.7 
 
 
102 aa  58.2  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.763235  hitchhiker  0.00476248 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3152  hypothetical protein  37.35 
 
 
122 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.412403  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3476  hypothetical protein  37.35 
 
 
122 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.404419  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3348  hypothetical protein  36.14 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.682693  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3808  hypothetical protein  36.59 
 
 
118 aa  55.5  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0320919 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1070  hypothetical protein  36.78 
 
 
109 aa  53.9  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.215268 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4533  hypothetical protein  34.94 
 
 
115 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.561656  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0541  hypothetical protein  33.73 
 
 
117 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.752321 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3260  hypothetical protein  33.73 
 
 
121 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.161528 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>