26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0541 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0541  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  230  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.752321 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3152  hypothetical protein  60.16 
 
 
122 aa  134  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.412403  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3476  hypothetical protein  60 
 
 
122 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.404419  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3348  hypothetical protein  61.34 
 
 
118 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.682693  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3260  hypothetical protein  51.82 
 
 
121 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.161528 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4533  hypothetical protein  56.25 
 
 
115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.561656  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0463  hypothetical protein  36.73 
 
 
101 aa  67  0.00000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0554  hypothetical protein  36.73 
 
 
101 aa  63.9  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1070  hypothetical protein  41.49 
 
 
109 aa  62.8  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.215268 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0792  hypothetical protein  36.56 
 
 
100 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.576927 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0752  hypothetical protein  34.65 
 
 
99 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0869  hypothetical protein  34.41 
 
 
100 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0737512  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3808  hypothetical protein  37.8 
 
 
118 aa  59.3  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0320919 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1466  hypothetical protein  35.71 
 
 
89 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64047  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0095  hypothetical protein  42.67 
 
 
87 aa  57.8  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0797  hypothetical protein  35.05 
 
 
102 aa  57.4  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.763235  hitchhiker  0.00476248 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4618  hypothetical protein  35 
 
 
100 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.549833  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0196  hypothetical protein  33.33 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0225  hypothetical protein  33.73 
 
 
88 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1035  hypothetical protein  34.09 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.537516  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0401  hypothetical protein  30.95 
 
 
88 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0322  hypothetical protein  28.57 
 
 
88 aa  47  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.835097  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0308  hypothetical protein  28.57 
 
 
88 aa  47  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0158  hypothetical protein  34.88 
 
 
88 aa  44.3  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.438063  normal  0.749446 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0589  hypothetical protein  28.57 
 
 
88 aa  44.3  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0683  ABC transporter, permease protein, putative  29.81 
 
 
788 aa  40.4  0.008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0106782 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>