24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3260 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3260  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  233  6e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.161528 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4533  hypothetical protein  77.69 
 
 
115 aa  187  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.561656  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3152  hypothetical protein  60.55 
 
 
122 aa  117  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.412403  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3476  hypothetical protein  60.55 
 
 
122 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.404419  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0541  hypothetical protein  51.82 
 
 
117 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.752321 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3348  hypothetical protein  60.4 
 
 
118 aa  110  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.682693  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0463  hypothetical protein  41.67 
 
 
101 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0797  hypothetical protein  43.01 
 
 
102 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.763235  hitchhiker  0.00476248 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1466  hypothetical protein  41.46 
 
 
89 aa  64.3  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64047  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0792  hypothetical protein  41.67 
 
 
100 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.576927 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4618  hypothetical protein  38.95 
 
 
100 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.549833  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0554  hypothetical protein  42.27 
 
 
101 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0869  hypothetical protein  39.29 
 
 
100 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0737512  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1070  hypothetical protein  34.02 
 
 
109 aa  60.8  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.215268 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0752  hypothetical protein  42.86 
 
 
99 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3808  hypothetical protein  41.67 
 
 
118 aa  58.5  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0320919 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0401  hypothetical protein  38.27 
 
 
88 aa  52.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0196  hypothetical protein  35.29 
 
 
88 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0225  hypothetical protein  33.73 
 
 
88 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0322  hypothetical protein  35.8 
 
 
88 aa  48.5  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.835097  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0308  hypothetical protein  35.8 
 
 
88 aa  48.5  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1035  hypothetical protein  36.14 
 
 
91 aa  47.8  0.00006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.537516  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0095  hypothetical protein  37.33 
 
 
87 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0451  hypothetical protein  32.91 
 
 
90 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00606209  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>