32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2651 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2651  hypothetical protein  100 
 
 
82 aa  163  8e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.149557  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5107  hypothetical protein  58.67 
 
 
96 aa  95.5  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.496431 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1325  hypothetical protein  60 
 
 
96 aa  92.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3445  protein of unknown function DUF1330  57.89 
 
 
96 aa  88.6  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0913  protein of unknown function DUF1330  54.17 
 
 
96 aa  81.3  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3183  hypothetical protein  52 
 
 
96 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.614337  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1090  hypothetical protein  52.63 
 
 
97 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1054  hypothetical protein  50 
 
 
96 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1067  protein of unknown function DUF1330  48.68 
 
 
96 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108805  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0971  protein of unknown function DUF1330  48.68 
 
 
96 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0127294  normal  0.0142522 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1128  hypothetical protein  48.68 
 
 
96 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6612  hypothetical protein  39.19 
 
 
104 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4723  hypothetical protein  37.66 
 
 
102 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2285  hypothetical protein  32.47 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0613201  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4055  hypothetical protein  38.67 
 
 
112 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3743  hypothetical protein  43.86 
 
 
98 aa  47.8  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6409  protein of unknown function DUF1330  38.67 
 
 
97 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3703  hypothetical protein  38.67 
 
 
96 aa  47  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.12428 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3229  hypothetical protein  34.72 
 
 
95 aa  45.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0722  protein of unknown function DUF1330  36.99 
 
 
102 aa  44.7  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1655  protein of unknown function DUF1330  27.63 
 
 
96 aa  44.3  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0092  protein of unknown function DUF1330  27.63 
 
 
96 aa  44.7  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1110  hypothetical protein  36.36 
 
 
96 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2337  protein of unknown function DUF1330  32.05 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4815  protein of unknown function DUF1330  37.33 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353052  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1359  hypothetical protein  41.33 
 
 
103 aa  42.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102563  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2076  hypothetical protein  33.33 
 
 
95 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2403  hypothetical protein  32 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.79558  normal  0.741886 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0684  hypothetical protein  33.33 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4211  protein of unknown function DUF1330  43.4 
 
 
95 aa  41.6  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2630  hypothetical protein  36 
 
 
114 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.152361 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2483  hypothetical protein  32 
 
 
97 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>