19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1462 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1462  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  400  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1246  hypothetical protein  48.48 
 
 
231 aa  157  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0493  hypothetical protein  53.67 
 
 
211 aa  156  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.838397  normal  0.0794721 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4232  hypothetical protein  52.46 
 
 
233 aa  154  7e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.828163  normal  0.182631 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0504  hypothetical protein  53.11 
 
 
204 aa  153  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.812702  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4090  hypothetical protein  36.89 
 
 
201 aa  108  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0973  hypothetical protein  36.11 
 
 
206 aa  101  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0515  hypothetical protein  38.86 
 
 
208 aa  94.4  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0555  putative lipoprotein  31.66 
 
 
211 aa  71.6  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.824529  normal  0.88861 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0100  putative lipoprotein  34.29 
 
 
216 aa  63.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00321337 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2612  putative lipoprotein  29.25 
 
 
237 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0984  putative lipoprotein  29.25 
 
 
237 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2921  putative lipoprotein  29.25 
 
 
237 aa  48.9  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.959785  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0163  putative lipoprotein  29.25 
 
 
237 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3027  putative lipoprotein  29.25 
 
 
237 aa  48.9  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0465  putative lipoprotein  29.25 
 
 
237 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0709301  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2981  putative lipoprotein  29.25 
 
 
237 aa  48.5  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0924  putative transmembrane lipoprotein  27.13 
 
 
234 aa  43.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132488  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2442  lipoprotein transmembrane  27.14 
 
 
223 aa  42.7  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>