47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2442 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2442  lipoprotein transmembrane  100 
 
 		 223 aa  448  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0877  hypothetical protein  72.6 
 
 		 216 aa  299  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2264  putative lipoprotein transmembrane  51.38 
 
 		 222 aa  185  6e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0186714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1941  lipoprotein transmembrane  50.92 
 
 		 222 aa  184  8e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.418069  normal  0.0186336 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2124  lipoprotein transmembrane  50.77 
 
 		 213 aa  180  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167848  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0465  putative lipoprotein  43.6 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0709301  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0163  putative lipoprotein  43.6 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2981  putative lipoprotein  43.6 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2921  putative lipoprotein  43.6 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.959785  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0984  putative lipoprotein  43.6 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2612  putative lipoprotein  43.6 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3027  putative lipoprotein  43.6 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4127  hypothetical protein  41.86 
 
 		 232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.272713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2379  hypothetical protein  39.35 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.323215  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0975  hypothetical protein  42.52 
 
 		 236 aa  128  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0629475 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1016  hypothetical protein  38.99 
 
 		 236 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0537  hypothetical protein  38.99 
 
 		 236 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3067  putative transmembrane lipoprotein  39.91 
 
 		 234 aa  125  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0879  hypothetical protein  38.14 
 
 		 233 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0891  hypothetical protein  38.14 
 
 		 233 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0924  putative transmembrane lipoprotein  39.38 
 
 		 234 aa  122  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0687  putative transmembrane lipoprotein  40.93 
 
 		 233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0589  hypothetical protein  29.6 
 
 		 232 aa  81.6  0.000000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.29516  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1658  putative lipoprotein  28.71 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0879001 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4994  putative lipoprotein  29.95 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2547  hitchhiker  0.00226373 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1319  hypothetical protein  31.37 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1358  hypothetical protein  30.88 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234925  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0925  putative lipoprotein  33.52 
 
 		 205 aa  62  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1844  putative lipoprotein  33.52 
 
 		 205 aa  62  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331282  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0739  putative lipoprotein  33.52 
 
 		 205 aa  62  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1689  putative lipoprotein  33.52 
 
 		 205 aa  62  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.951198  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1667  putative lipoprotein  33.52 
 
 		 205 aa  62  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.801077  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1514  hypothetical protein  28.44 
 
 		 233 aa  62  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0424  putative lipoprotein  33.52 
 
 		 205 aa  62  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1458  putative lipoprotein  33.52 
 
 		 205 aa  62  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0957  hypothetical protein  30.73 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247971  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1439  hypothetical protein  30.73 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166739  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1417  hypothetical protein  30.73 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1876  hypothetical protein  30.17 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0318105 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2635  putative lipoprotein  30.6 
 
 		 201 aa  53.5  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4583  hypothetical protein  28.99 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2012  hypothetical protein  27.5 
 
 		 229 aa  48.9  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.581961  normal  0.0111404 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0515  hypothetical protein  29.85 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0100  putative lipoprotein  30.05 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00321337 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1246  hypothetical protein  29.6 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4090  hypothetical protein  28.21 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0555  putative lipoprotein  28.21 
 
 		 211 aa  42  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.824529  normal  0.88861 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>