26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0555 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0555  putative lipoprotein  100 
 
 		 211 aa  428  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.824529  normal  0.88861 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0100  putative lipoprotein  42.19 
 
 		 216 aa  122  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00321337 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4090  hypothetical protein  35.55 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0515  hypothetical protein  33.02 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1246  hypothetical protein  32.86 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0973  hypothetical protein  33.79 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1462  hypothetical protein  31.31 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0877  hypothetical protein  30.05 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4232  hypothetical protein  31.02 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.828163  normal  0.182631 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0465  putative lipoprotein  30.3 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0709301  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0163  putative lipoprotein  30.3 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2921  putative lipoprotein  30.3 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.959785  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0984  putative lipoprotein  30.3 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2612  putative lipoprotein  30.3 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3027  putative lipoprotein  30.3 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2981  putative lipoprotein  30.3 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0493  hypothetical protein  35.71 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.838397  normal  0.0794721 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0504  hypothetical protein  35.71 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.812702  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2442  lipoprotein transmembrane  27.41 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1941  lipoprotein transmembrane  27.06 
 
 		 222 aa  48.1  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.418069  normal  0.0186336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2264  putative lipoprotein transmembrane  26.96 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0186714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2379  hypothetical protein  27.85 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.323215  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2124  lipoprotein transmembrane  27.92 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0924  putative transmembrane lipoprotein  27.66 
 
 		 234 aa  42.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3067  putative transmembrane lipoprotein  26.94 
 
 		 234 aa  42.4  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0975  hypothetical protein  28 
 
 		 236 aa  41.2  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0629475 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>