24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0973 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0973  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  415  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4090  hypothetical protein  40.28 
 
 		 201 aa  137  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0515  hypothetical protein  38.78 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1462  hypothetical protein  42.47 
 
 		 202 aa  112  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1246  hypothetical protein  36.02 
 
 		 231 aa  109  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0493  hypothetical protein  42.02 
 
 		 211 aa  102  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.838397  normal  0.0794721 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0504  hypothetical protein  42.02 
 
 		 204 aa  101  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.812702  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4232  hypothetical protein  39.89 
 
 		 233 aa  92.4  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.828163  normal  0.182631 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0100  putative lipoprotein  36.98 
 
 		 216 aa  89  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00321337 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0555  putative lipoprotein  38.74 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.824529  normal  0.88861 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2442  lipoprotein transmembrane  30.5 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0877  hypothetical protein  29.77 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1514  hypothetical protein  28.3 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2612  putative lipoprotein  27.64 
 
 		 237 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0163  putative lipoprotein  27.64 
 
 		 237 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2921  putative lipoprotein  27.64 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.959785  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0984  putative lipoprotein  27.64 
 
 		 237 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0924  putative transmembrane lipoprotein  26.55 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3027  putative lipoprotein  27.64 
 
 		 237 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0465  putative lipoprotein  27.64 
 
 		 237 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0709301  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2981  putative lipoprotein  28.64 
 
 		 237 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2124  lipoprotein transmembrane  29.15 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3067  putative transmembrane lipoprotein  25.42 
 
 		 234 aa  42.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0589  hypothetical protein  26.36 
 
 		 232 aa  42.4  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.29516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>