32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0981 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0981  hypothetical protein  100 
 
 		 64 aa  123  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0522  hypothetical protein  53.12 
 
 		 64 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4223  hypothetical protein  65.62 
 
 		 64 aa  75.5  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555481 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4085  hypothetical protein  51.56 
 
 		 64 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1253  hypothetical protein  65.62 
 
 		 64 aa  70.5  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3734  hypothetical protein  53.23 
 
 		 64 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0151275  normal  0.610922 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0202  hypothetical protein  51.56 
 
 		 64 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2896  hypothetical protein  50 
 
 		 64 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0750135 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0515  hypothetical protein  59.38 
 
 		 64 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0499  hypothetical protein  59.38 
 
 		 64 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.139972 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0223  hypothetical protein  43.75 
 
 		 64 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0105  hypothetical protein  46.03 
 
 		 63 aa  66.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000261109 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0550  hypothetical protein  56.25 
 
 		 64 aa  65.5  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.349881 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0180  hypothetical protein  42.19 
 
 		 64 aa  63.5  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1467  hypothetical protein  65.22 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2362  hypothetical protein  39.06 
 
 		 64 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21694  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2976  hypothetical protein  39.06 
 
 		 64 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2996  hypothetical protein  39.06 
 
 		 64 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6325  hypothetical protein  39.06 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.999223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4136  hypothetical protein  38.46 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3023  hypothetical protein  37.5 
 
 		 70 aa  52  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2886  hypothetical protein  37.5 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2971  hypothetical protein  37.5 
 
 		 64 aa  50.8  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0811  hypothetical protein  59.68 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0295  hypothetical protein  38.1 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.382928  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0331  hypothetical protein  38.1 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0344  hypothetical protein  38.1 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.166493  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2249  hypothetical protein  38.1 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2035  hypothetical protein  38.1 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.938809  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3058  hypothetical protein  38.1 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0524  hypothetical protein  38.1 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.523411  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3385  hypothetical protein  38.1 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000135899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>