32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1253 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1253  hypothetical protein  100 
 
 
64 aa  119  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0522  hypothetical protein  53.12 
 
 
64 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0223  hypothetical protein  57.14 
 
 
64 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4085  hypothetical protein  54.69 
 
 
64 aa  73.9  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0180  hypothetical protein  57.14 
 
 
64 aa  72.8  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0981  hypothetical protein  65.62 
 
 
64 aa  72  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0515  hypothetical protein  69.35 
 
 
64 aa  70.5  0.000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0499  hypothetical protein  69.35 
 
 
64 aa  70.5  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.139972 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4223  hypothetical protein  60.94 
 
 
64 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.555481 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0550  hypothetical protein  56.25 
 
 
64 aa  65.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.349881 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0105  hypothetical protein  49.21 
 
 
63 aa  65.5  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000261109 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0202  hypothetical protein  47.62 
 
 
64 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3734  hypothetical protein  44.44 
 
 
64 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0151275  normal  0.610922 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2896  hypothetical protein  46.88 
 
 
64 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0750135 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0295  hypothetical protein  42.86 
 
 
64 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.382928  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2362  hypothetical protein  38.1 
 
 
64 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21694  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2996  hypothetical protein  38.1 
 
 
64 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2976  hypothetical protein  38.1 
 
 
64 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3058  hypothetical protein  42.86 
 
 
64 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2249  hypothetical protein  42.86 
 
 
64 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0344  hypothetical protein  42.86 
 
 
64 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.166493  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0331  hypothetical protein  42.86 
 
 
64 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2035  hypothetical protein  42.86 
 
 
64 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.938809  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3385  hypothetical protein  42.86 
 
 
64 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000135899  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0524  hypothetical protein  42.86 
 
 
64 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.523411  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6325  hypothetical protein  36.51 
 
 
64 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.999223  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1467  hypothetical protein  60.87 
 
 
98 aa  51.6  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3023  hypothetical protein  34.92 
 
 
70 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2886  hypothetical protein  34.92 
 
 
64 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2971  hypothetical protein  36.51 
 
 
64 aa  50.4  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0811  hypothetical protein  56.25 
 
 
64 aa  48.9  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4136  hypothetical protein  36.92 
 
 
75 aa  44.7  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>