35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4085 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4085  hypothetical protein  100 
 
 
64 aa  122  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0522  hypothetical protein  92.19 
 
 
64 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0223  hypothetical protein  54.69 
 
 
64 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1467  hypothetical protein  71.74 
 
 
98 aa  72  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4223  hypothetical protein  60.94 
 
 
64 aa  71.2  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.555481 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0180  hypothetical protein  53.12 
 
 
64 aa  70.9  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0515  hypothetical protein  59.68 
 
 
64 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0499  hypothetical protein  59.68 
 
 
64 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.139972 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0550  hypothetical protein  53.12 
 
 
64 aa  64.7  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.349881 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0202  hypothetical protein  46.88 
 
 
64 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0981  hypothetical protein  51.56 
 
 
64 aa  62.8  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2896  hypothetical protein  48.44 
 
 
64 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0750135 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3734  hypothetical protein  43.75 
 
 
64 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0151275  normal  0.610922 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1253  hypothetical protein  54.69 
 
 
64 aa  61.6  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0811  hypothetical protein  57.81 
 
 
64 aa  55.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2976  hypothetical protein  35.94 
 
 
64 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2362  hypothetical protein  35.94 
 
 
64 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21694  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2996  hypothetical protein  35.94 
 
 
64 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0105  hypothetical protein  33.33 
 
 
63 aa  51.6  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000261109 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6325  hypothetical protein  35.94 
 
 
64 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.999223  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3023  hypothetical protein  34.38 
 
 
70 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2886  hypothetical protein  34.38 
 
 
64 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2971  hypothetical protein  35.94 
 
 
64 aa  48.9  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0331  hypothetical protein  38.1 
 
 
64 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3385  hypothetical protein  38.1 
 
 
64 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000135899  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0524  hypothetical protein  38.1 
 
 
64 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.523411  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2249  hypothetical protein  38.1 
 
 
64 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0344  hypothetical protein  38.1 
 
 
64 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.166493  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2035  hypothetical protein  38.1 
 
 
64 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.938809  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3058  hypothetical protein  38.1 
 
 
64 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3504  hypothetical protein  45.31 
 
 
66 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0295  hypothetical protein  34.92 
 
 
64 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.382928  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4136  hypothetical protein  35.38 
 
 
75 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0085  hypothetical protein  41.94 
 
 
69 aa  44.3  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2317  hypothetical protein  44.83 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00433359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>