34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1029 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1029  phage terminase, endonuclease subunit  100 
 
 		 238 aa  496  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1054  putative terminase, endonuclease subunit  52.72 
 
 		 238 aa  261  1e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05028  hypothetical protein  52.38 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3490  phage terminase subunit  46.81 
 
 		 234 aa  222  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.745840000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2933  phage terminase subunit  46.38 
 
 		 233 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.4642299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0940  small terminase subunit  45.58 
 
 		 247 aa  206  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0900  small terminase subunit  38.63 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0679856  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2797  phage terminase subunit  39.66 
 
 		 232 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0724  putative phage gene  45.77 
 
 		 152 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.119096 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1286  putative phage gene  48.67 
 
 		 132 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5055  putative terminase, endonuclease subunit  34.21 
 
 		 245 aa  108  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.295868  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0701  putative terminase, endonuclease subunit  33.68 
 
 		 245 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0242  small terminase subunit  30.73 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2764  phage small terminase subunit  26.88 
 
 		 244 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.734081 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1469  phage small terminase subunit  27.01 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0584  phage small terminase subunit  29.93 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.823019 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2330  small terminase subunit  27.18 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.092391  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4367  gpM  28.57 
 
 		 252 aa  72  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.269266  hitchhiker  0.00000000191382 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1349  Phage small terminase subunit  23.53 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631398  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4838  small terminase subunit  21.03 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3174  small terminase subunit  24.23 
 
 		 219 aa  65.1  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37580  Phage P2 small terminase subunit gpM-like protein  21.63 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0204  small terminase subunit  22.78 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.122347 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2913  small terminase subunit  22.45 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.193683  normal  0.722057 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1936  bacteriophage protein  24.87 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.381578  normal  0.864089 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1396  phage small terminase subunit  23.5 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3292  phage small terminase subunit  25.55 
 
 		 260 aa  57  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3498  phage small terminase subunit  23.59 
 
 		 251 aa  52  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0698  hypothetical protein  22.73 
 
 		 281 aa  50.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01360  phage-related terminase  22.46 
 
 		 239 aa  50.1  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0374547  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4326  phage small terminase subunit GpM  25.52 
 
 		 247 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609107 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3049  phage small terminase subunit GpM  24.31 
 
 		 247 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107773 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2644  small terminase subunit  22.7 
 
 		 273 aa  47  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0867439  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3830  small terminase subunit  27.27 
 
 		 293 aa  43.1  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>