35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1936 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1936  bacteriophage protein  100 
 
 		 240 aa  489  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.381578  normal  0.864089 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4838  small terminase subunit  53.14 
 
 		 228 aa  246  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0204  small terminase subunit  54.39 
 
 		 228 aa  234  9e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.122347 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1396  phage small terminase subunit  52.4 
 
 		 221 aa  211  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3174  small terminase subunit  50.22 
 
 		 219 aa  206  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37580  Phage P2 small terminase subunit gpM-like protein  48.47 
 
 		 229 aa  200  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1349  Phage small terminase subunit  47.9 
 
 		 229 aa  199  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631398  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01360  phage-related terminase  45.58 
 
 		 239 aa  190  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0374547  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2913  small terminase subunit  47.58 
 
 		 234 aa  189  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.193683  normal  0.722057 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4367  gpM  46.9 
 
 		 252 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.269266  hitchhiker  0.00000000191382 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3292  phage small terminase subunit  47.64 
 
 		 260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2774  small terminase subunit  46.05 
 
 		 216 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000168159 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3047  terminase, endonuclease subunit  45.61 
 
 		 216 aa  178  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017851 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0927  terminase, endonuclease subunit  45.61 
 
 		 216 aa  177  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4326  phage small terminase subunit GpM  44.87 
 
 		 247 aa  174  9e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609107 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3049  phage small terminase subunit GpM  45.58 
 
 		 247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107773 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3498  phage small terminase subunit  46.26 
 
 		 251 aa  168  6e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2330  small terminase subunit  38.94 
 
 		 217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.092391  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2865  terminase, endonuclease subunit  43.86 
 
 		 216 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2644  small terminase subunit  39.83 
 
 		 273 aa  152  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0867439  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3830  small terminase subunit  39.66 
 
 		 293 aa  150  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0242  small terminase subunit  29.86 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2764  phage small terminase subunit  28.19 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.734081 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1054  putative terminase, endonuclease subunit  27.92 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1469  phage small terminase subunit  27.05 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0701  putative terminase, endonuclease subunit  28.57 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1029  phage terminase, endonuclease subunit  24.87 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5055  putative terminase, endonuclease subunit  28.02 
 
 		 245 aa  62  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.295868  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3490  phage terminase subunit  25.71 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.745840000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2933  phage terminase subunit  25.71 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.4642299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0900  small terminase subunit  28.81 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0679856  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0584  phage small terminase subunit  29.01 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.823019 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05028  hypothetical protein  25 
 
 		 238 aa  52.8  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2797  phage terminase subunit  24.89 
 
 		 232 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0940  small terminase subunit  28.08 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>