35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1396 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1396  phage small terminase subunit  100 
 
 		 221 aa  442  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0204  small terminase subunit  56.62 
 
 		 228 aa  204  7e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.122347 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4838  small terminase subunit  54.13 
 
 		 228 aa  204  9e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1936  bacteriophage protein  52.4 
 
 		 240 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.381578  normal  0.864089 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1349  Phage small terminase subunit  54.59 
 
 		 229 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631398  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3174  small terminase subunit  48.61 
 
 		 219 aa  186  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3047  terminase, endonuclease subunit  52.75 
 
 		 216 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017851 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0927  terminase, endonuclease subunit  52.75 
 
 		 216 aa  181  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2774  small terminase subunit  52.29 
 
 		 216 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000168159 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4367  gpM  49.08 
 
 		 252 aa  178  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.269266  hitchhiker  0.00000000191382 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3049  phage small terminase subunit GpM  50.68 
 
 		 247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107773 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4326  phage small terminase subunit GpM  49.78 
 
 		 247 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609107 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37580  Phage P2 small terminase subunit gpM-like protein  47.77 
 
 		 229 aa  169  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2913  small terminase subunit  41.18 
 
 		 234 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.193683  normal  0.722057 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3498  phage small terminase subunit  47.75 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3292  phage small terminase subunit  42.24 
 
 		 260 aa  160  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2330  small terminase subunit  39.53 
 
 		 217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.092391  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2865  terminase, endonuclease subunit  48.37 
 
 		 216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01360  phage-related terminase  42.36 
 
 		 239 aa  150  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0374547  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2644  small terminase subunit  41.36 
 
 		 273 aa  134  8e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0867439  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3830  small terminase subunit  37.22 
 
 		 293 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0584  phage small terminase subunit  30.85 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.823019 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0242  small terminase subunit  27.51 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1029  phage terminase, endonuclease subunit  23.5 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3490  phage terminase subunit  27.68 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.745840000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2933  phage terminase subunit  27.68 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.4642299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0698  hypothetical protein  26.86 
 
 		 281 aa  59.3  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2764  phage small terminase subunit  29.51 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.734081 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1469  phage small terminase subunit  28.96 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1054  putative terminase, endonuclease subunit  25.21 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05028  hypothetical protein  25.87 
 
 		 238 aa  57  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0701  putative terminase, endonuclease subunit  28.49 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5055  putative terminase, endonuclease subunit  27.91 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.295868  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0940  small terminase subunit  33.33 
 
 		 247 aa  49.7  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0900  small terminase subunit  29.25 
 
 		 232 aa  45.1  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0679856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>