25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004391 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_004391  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  229  9e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.877074  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01019  hypothetical protein  89.09 
 
 
110 aa  210  5.999999999999999e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1482  hypothetical protein  41.82 
 
 
109 aa  106  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0248  hypothetical protein  50 
 
 
107 aa  99.8  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.308727  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3672  hypothetical protein  42.73 
 
 
110 aa  99.4  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0053  hypothetical protein  41.82 
 
 
108 aa  95.9  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141355  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3246  hypothetical protein  38.53 
 
 
110 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.613831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2460  hypothetical protein  39.45 
 
 
110 aa  94  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2933  hypothetical protein  39.45 
 
 
110 aa  93.6  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2496  hypothetical protein  39.45 
 
 
110 aa  93.2  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000193246  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4248  hypothetical protein  39.45 
 
 
110 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000465332 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1746  hypothetical protein  35.45 
 
 
108 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.657969  hitchhiker  0.00769582 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1964  hypothetical protein  33.64 
 
 
110 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00423146 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2289  hypothetical protein  31.82 
 
 
110 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0738008  hitchhiker  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2326  hypothetical protein  30 
 
 
110 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.014662  normal  0.0876404 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2080  hypothetical protein  31.19 
 
 
110 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000823653  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2076  hypothetical protein  31.19 
 
 
110 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00166277  hitchhiker  0.00000116624 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2386  hypothetical protein  31.19 
 
 
110 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0700784  hitchhiker  0.000108776 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2269  hypothetical protein  31.19 
 
 
110 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000524923  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2084  hypothetical protein  29.09 
 
 
110 aa  59.3  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2032  hypothetical protein  31.82 
 
 
110 aa  59.7  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2391  hypothetical protein  31.82 
 
 
110 aa  57.4  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1934  hypothetical protein  31.82 
 
 
110 aa  57  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.438545  hitchhiker  0.000000583672 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2042  hypothetical protein  31.82 
 
 
110 aa  57  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0625081 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1987  hypothetical protein  31.82 
 
 
110 aa  57  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.082971  hitchhiker  0.0000534909 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>