25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1964 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1964  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  232  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00423146 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2289  hypothetical protein  58.18 
 
 		 110 aa  149  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0738008  hitchhiker  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2386  hypothetical protein  60.55 
 
 		 110 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0700784  hitchhiker  0.000108776 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2080  hypothetical protein  60.55 
 
 		 110 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000823653  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2076  hypothetical protein  60.55 
 
 		 110 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00166277  hitchhiker  0.00000116624 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2269  hypothetical protein  60.55 
 
 		 110 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000524923  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2391  hypothetical protein  58.72 
 
 		 110 aa  140  6e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1934  hypothetical protein  57.8 
 
 		 110 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.438545  hitchhiker  0.000000583672 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2042  hypothetical protein  57.8 
 
 		 110 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0625081 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1987  hypothetical protein  57.8 
 
 		 110 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.082971  hitchhiker  0.0000534909 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2032  hypothetical protein  57.8 
 
 		 110 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2326  hypothetical protein  50.91 
 
 		 110 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.014662  normal  0.0876404 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2084  hypothetical protein  52.73 
 
 		 110 aa  124  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1746  hypothetical protein  37.27 
 
 		 108 aa  84.7  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.657969  hitchhiker  0.00769582 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004391  hypothetical protein  33.64 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.877074  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0053  hypothetical protein  34.55 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141355  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01019  hypothetical protein  30.91 
 
 		 110 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2460  hypothetical protein  33.03 
 
 		 110 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3672  hypothetical protein  29.09 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2933  hypothetical protein  32.11 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4248  hypothetical protein  32.11 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000465332 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2496  hypothetical protein  32.11 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000193246  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3246  hypothetical protein  30.28 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.613831  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1482  hypothetical protein  30.63 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0248  hypothetical protein  30.91 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.308727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>