25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2289 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2289  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  233  9e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0738008  hitchhiker  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2076  hypothetical protein  63.3 
 
 		 110 aa  155  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00166277  hitchhiker  0.00000116624 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2386  hypothetical protein  63.3 
 
 		 110 aa  155  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0700784  hitchhiker  0.000108776 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2080  hypothetical protein  63.3 
 
 		 110 aa  155  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000823653  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2269  hypothetical protein  63.3 
 
 		 110 aa  155  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000524923  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2326  hypothetical protein  62.73 
 
 		 110 aa  154  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.014662  normal  0.0876404 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1934  hypothetical protein  62.39 
 
 		 110 aa  150  7e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.438545  hitchhiker  0.000000583672 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2042  hypothetical protein  62.39 
 
 		 110 aa  150  7e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0625081 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1987  hypothetical protein  62.39 
 
 		 110 aa  150  7e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.082971  hitchhiker  0.0000534909 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2032  hypothetical protein  61.47 
 
 		 110 aa  149  8.999999999999999e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1964  hypothetical protein  58.18 
 
 		 110 aa  149  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00423146 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2084  hypothetical protein  60 
 
 		 110 aa  148  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2391  hypothetical protein  61.47 
 
 		 110 aa  147  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1746  hypothetical protein  40.91 
 
 		 108 aa  87.4  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.657969  hitchhiker  0.00769582 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01019  hypothetical protein  31.82 
 
 		 110 aa  73.9  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004391  hypothetical protein  31.82 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.877074  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1482  hypothetical protein  35.45 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3672  hypothetical protein  31.82 
 
 		 110 aa  70.1  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2933  hypothetical protein  34.55 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2460  hypothetical protein  33.64 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4248  hypothetical protein  33.64 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000465332 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0053  hypothetical protein  30 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141355  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2496  hypothetical protein  33.64 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000193246  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3246  hypothetical protein  31.19 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.613831  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0248  hypothetical protein  30 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.308727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>