27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004343 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004343  hypothetical protein  100 
 
 		 74 aa  154  5.0000000000000005e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0295  hypothetical protein  71.83 
 
 		 77 aa  114  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0735  hypothetical protein  60 
 
 		 78 aa  94  7e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3603  hypothetical protein  44.93 
 
 		 73 aa  72  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.733316  normal  0.243305 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2662  hypothetical protein  50 
 
 		 71 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.279244 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0411  hypothetical protein  39.44 
 
 		 74 aa  61.6  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000158392  hitchhiker  0.00072646 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1299  hypothetical protein  38.03 
 
 		 74 aa  61.2  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000317329  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1192  hypothetical protein  38.03 
 
 		 74 aa  61.2  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110371  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2732  protein of unknown function DUF1407  38.57 
 
 		 77 aa  61.2  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0278358  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3001  hypothetical protein  46.97 
 
 		 71 aa  60.8  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00218374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2712  hypothetical protein  46.88 
 
 		 73 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2775  hypothetical protein  46.88 
 
 		 73 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00403808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2669  hypothetical protein  46.88 
 
 		 73 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2886  hypothetical protein  46.88 
 
 		 73 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1173  hypothetical protein  44.93 
 
 		 76 aa  58.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0778784  normal  0.182143 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2756  hypothetical protein  45.31 
 
 		 73 aa  57  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2661  hypothetical protein  42.19 
 
 		 71 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.68483e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1167  hypothetical protein  42.19 
 
 		 71 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000134693  decreased coverage  0.00937361 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1123  protein of unknown function DUF1407  31.4 
 
 		 92 aa  51.6  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.282712  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3733  hypothetical protein  40.62 
 
 		 71 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00168899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2884  hypothetical protein  40.62 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254001  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2793  hypothetical protein  40.62 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000600467  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3008  hypothetical protein  35.29 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0505095  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1264  protein of unknown function DUF1407  36.76 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.286121  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02402  hypothetical protein  40.62 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000963393  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02364  hypothetical protein  40.62 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000142419  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1158  protein of unknown function DUF1407  40.62 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000674514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>