26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3008 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3008  hypothetical protein  100 
 
 		 74 aa  157  6e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0505095  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1264  protein of unknown function DUF1407  79.73 
 
 		 74 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.286121  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3603  hypothetical protein  54.79 
 
 		 73 aa  79.7  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.733316  normal  0.243305 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1192  hypothetical protein  56 
 
 		 74 aa  79  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110371  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2732  protein of unknown function DUF1407  50 
 
 		 77 aa  79.3  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0278358  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0411  hypothetical protein  57.33 
 
 		 74 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000158392  hitchhiker  0.00072646 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1299  hypothetical protein  56 
 
 		 74 aa  79  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000317329  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1158  protein of unknown function DUF1407  55.07 
 
 		 71 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000674514  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02364  hypothetical protein  55.07 
 
 		 71 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000142419  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2886  hypothetical protein  48.61 
 
 		 73 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2669  hypothetical protein  48.61 
 
 		 73 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2775  hypothetical protein  48.61 
 
 		 73 aa  68.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00403808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2712  hypothetical protein  48.61 
 
 		 73 aa  68.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02402  hypothetical protein  55.07 
 
 		 71 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000963393  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2884  hypothetical protein  55.07 
 
 		 71 aa  67  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254001  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2793  hypothetical protein  55.07 
 
 		 71 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000600467  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3733  hypothetical protein  55.07 
 
 		 71 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00168899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2756  hypothetical protein  47.22 
 
 		 73 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1167  hypothetical protein  55.07 
 
 		 71 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000134693  decreased coverage  0.00937361 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2661  hypothetical protein  55.07 
 
 		 71 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.68483e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1123  protein of unknown function DUF1407  37.36 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.282712  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3001  hypothetical protein  50 
 
 		 71 aa  61.6  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00218374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2662  hypothetical protein  50.77 
 
 		 71 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.279244 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0295  hypothetical protein  37.33 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0735  hypothetical protein  41.27 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004343  hypothetical protein  35.29 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>