27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3603 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3603  hypothetical protein  100 
 
 
73 aa  153  9e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.733316  normal  0.243305 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0411  hypothetical protein  63.01 
 
 
74 aa  100  8e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000158392  hitchhiker  0.00072646 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1192  hypothetical protein  61.64 
 
 
74 aa  99.8  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110371  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1299  hypothetical protein  61.64 
 
 
74 aa  99.8  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000317329  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2732  protein of unknown function DUF1407  55.41 
 
 
77 aa  91.7  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0278358  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2661  hypothetical protein  63.24 
 
 
71 aa  89  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.68483e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1167  hypothetical protein  63.24 
 
 
71 aa  89  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000134693  decreased coverage  0.00937361 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3733  hypothetical protein  61.76 
 
 
71 aa  87  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00168899  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2793  hypothetical protein  61.76 
 
 
71 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000600467  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2884  hypothetical protein  61.76 
 
 
71 aa  86.7  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254001  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1158  protein of unknown function DUF1407  60.29 
 
 
71 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000674514  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02364  hypothetical protein  60.29 
 
 
71 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000142419  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2886  hypothetical protein  60.29 
 
 
73 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3001  hypothetical protein  60.29 
 
 
71 aa  83.2  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00218374  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02402  hypothetical protein  60.29 
 
 
71 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000963393  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2712  hypothetical protein  60.29 
 
 
73 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2775  hypothetical protein  60.29 
 
 
73 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00403808  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2669  hypothetical protein  60.29 
 
 
73 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2756  hypothetical protein  58.82 
 
 
73 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1264  protein of unknown function DUF1407  54.79 
 
 
74 aa  80.5  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.286121  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0295  hypothetical protein  46.58 
 
 
77 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3008  hypothetical protein  54.79 
 
 
74 aa  79.7  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0505095  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2662  hypothetical protein  57.35 
 
 
71 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.279244 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1123  protein of unknown function DUF1407  42.86 
 
 
92 aa  72.4  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.282712  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004343  hypothetical protein  44.93 
 
 
74 aa  72  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0735  hypothetical protein  44.44 
 
 
78 aa  68.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1173  hypothetical protein  37.5 
 
 
76 aa  47.8  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0778784  normal  0.182143 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>