19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1173 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1173  hypothetical protein  100 
 
 		 76 aa  150  5.9999999999999996e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0778784  normal  0.182143 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0295  hypothetical protein  47.95 
 
 		 77 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0735  hypothetical protein  43.06 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004343  hypothetical protein  44.93 
 
 		 74 aa  58.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3603  hypothetical protein  37.5 
 
 		 73 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.733316  normal  0.243305 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2662  hypothetical protein  32.43 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.279244 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2756  hypothetical protein  30.26 
 
 		 73 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2712  hypothetical protein  30.26 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2775  hypothetical protein  30.26 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00403808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2669  hypothetical protein  28.95 
 
 		 73 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2886  hypothetical protein  28.95 
 
 		 73 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3733  hypothetical protein  31.51 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00168899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2661  hypothetical protein  30.14 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.68483e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1167  hypothetical protein  30.14 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000134693  decreased coverage  0.00937361 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2884  hypothetical protein  30.14 
 
 		 71 aa  41.6  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254001  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2793  hypothetical protein  30.14 
 
 		 71 aa  41.6  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000600467  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02402  hypothetical protein  30.14 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000963393  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02364  hypothetical protein  30.14 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000142419  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1158  protein of unknown function DUF1407  30.14 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000674514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>