23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001028 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001028  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  694    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07112  hypothetical protein  89.49 
 
 		 336 aa  630  1e-179  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0243  hypothetical protein  71.57 
 
 		 326 aa  464  9.999999999999999e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5776  hypothetical protein  40.06 
 
 		 318 aa  226  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0193  hypothetical protein  39.42 
 
 		 309 aa  216  5e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0365  pentein-type domain-containing protein  39.68 
 
 		 311 aa  214  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.529714  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1270  hypothetical protein  39.29 
 
 		 309 aa  211  2e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1720  pentein-type domain-containing protein  38.71 
 
 		 310 aa  211  2e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0873915  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05890  hypothetical protein  38.96 
 
 		 309 aa  209  6e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2742  hypothetical protein  36.63 
 
 		 303 aa  202  9e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2881  hypothetical protein  36.3 
 
 		 303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3576  amidinotransferase  38.29 
 
 		 354 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0346338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3944  amidinotransferase  37.66 
 
 		 336 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.271139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5310  amidinotransferase  37.66 
 
 		 346 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2543  amidinotransferase  38.22 
 
 		 333 aa  192  8e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3491  amidinotransferase  37.66 
 
 		 333 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.736651  normal  0.0264598 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1164  amidinotransferase family protein  36.19 
 
 		 309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0253709 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4680  hypothetical protein  36.69 
 
 		 308 aa  183  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2391  hypothetical protein  35.83 
 
 		 305 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.482221  normal  0.798046 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02830  uncharacterized conserved protein with pentein-type domain  32.5 
 
 		 340 aa  171  1e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31738  predicted protein  37.66 
 
 		 302 aa  170  3e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.193058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2023  amidinotransferase family protein  32.83 
 
 		 362 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.136244  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00362  hypothetical protein  33.77 
 
 		 319 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.117319  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>