23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4680 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_4680  hypothetical protein  100 
 
 
308 aa  641    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0193  hypothetical protein  42.48 
 
 
309 aa  261  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5776  hypothetical protein  42.24 
 
 
318 aa  259  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1270  hypothetical protein  44.7 
 
 
309 aa  254  1.0000000000000001e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1164  amidinotransferase family protein  40.98 
 
 
309 aa  228  1e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0253709 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0365  pentein-type domain-containing protein  39.61 
 
 
311 aa  224  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.529714  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1720  pentein-type domain-containing protein  41.12 
 
 
310 aa  220  3e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0873915  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3491  amidinotransferase  38.64 
 
 
333 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.736651  normal  0.0264598 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3944  amidinotransferase  38.19 
 
 
336 aa  211  9e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.271139  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2543  amidinotransferase  38.31 
 
 
333 aa  209  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3576  amidinotransferase  37.54 
 
 
354 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0346338  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5310  amidinotransferase  37.99 
 
 
346 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2881  hypothetical protein  38.74 
 
 
303 aa  196  3e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02830  uncharacterized conserved protein with pentein-type domain  37.42 
 
 
340 aa  196  5.000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0243  hypothetical protein  38.64 
 
 
326 aa  195  9e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05890  hypothetical protein  38.03 
 
 
309 aa  193  4e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00362  hypothetical protein  35.83 
 
 
319 aa  188  9e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.117319  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2742  hypothetical protein  37.09 
 
 
303 aa  186  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2023  amidinotransferase family protein  36.01 
 
 
362 aa  186  5e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.136244  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001028  hypothetical protein  36.69 
 
 
333 aa  183  4.0000000000000006e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31738  predicted protein  38.41 
 
 
302 aa  176  5e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.193058  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07112  hypothetical protein  34.6 
 
 
336 aa  171  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2391  hypothetical protein  35.79 
 
 
305 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.482221  normal  0.798046 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>