15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2651 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2651  putative lipoprotein  100 
 
 		 231 aa  481  1e-135  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00212  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  54.63 
 
 		 232 aa  260  1e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002183  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  53.45 
 
 		 232 aa  256  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.366273  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2845  putative lipoprotein  46.15 
 
 		 234 aa  214  7e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00807685  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0463  hypothetical protein  26.9 
 
 		 219 aa  57  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00842052  hitchhiker  0.00244821 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3845  putative lipoprotein  27.04 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0652074  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0355  hypothetical protein  27.04 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0991625  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0291  hypothetical protein  25.49 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0030425  normal  0.0114039 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4504  hypothetical protein  24.63 
 
 		 230 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0307529 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4502  hypothetical protein  24.63 
 
 		 230 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.58086  normal  0.0811597 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4382  hypothetical protein  24.63 
 
 		 230 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4415  hypothetical protein  24.63 
 
 		 230 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0517535  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4578  hypothetical protein  24.63 
 
 		 230 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.691286 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3863  protein of unknown function DUF1481  23.26 
 
 		 236 aa  46.2  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.454596  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3709  protein of unknown function DUF1481  22.15 
 
 		 210 aa  42.4  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0574933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>