25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0291 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0291  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  434  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0030425  normal  0.0114039 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3845  putative lipoprotein  58.49 
 
 
233 aa  269  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0652074  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0463  hypothetical protein  58.49 
 
 
219 aa  269  2.9999999999999997e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00842052  hitchhiker  0.00244821 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0355  hypothetical protein  58.49 
 
 
217 aa  269  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0991625  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3709  protein of unknown function DUF1481  54.93 
 
 
210 aa  235  4e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0574933  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0223  hypothetical protein  50.98 
 
 
228 aa  227  9e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.543212  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0227  protein of unknown function DUF1481  49.75 
 
 
227 aa  221  6e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.143449  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3863  protein of unknown function DUF1481  50.95 
 
 
236 aa  219  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.454596  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0214  hypothetical protein  48.79 
 
 
232 aa  194  9e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0096485  normal  0.0118868 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4235  hypothetical protein  47.89 
 
 
231 aa  192  4e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4544  hypothetical protein  47.89 
 
 
231 aa  192  4e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.145263  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03831  hypothetical protein  47.89 
 
 
231 aa  192  4e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.477079  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03878  hypothetical protein  47.89 
 
 
231 aa  192  4e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.353029  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4492  hypothetical protein  47.89 
 
 
231 aa  191  6e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0791634  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4449  hypothetical protein  48.83 
 
 
211 aa  191  7e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.32237  hitchhiker  0.00225378 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4024  hypothetical protein  48.83 
 
 
211 aa  191  7e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.760823  normal  0.0359052 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3993  protein of unknown function DUF1481  49.27 
 
 
211 aa  191  8e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5470  hypothetical protein  48.36 
 
 
211 aa  189  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.191236  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4502  hypothetical protein  47.29 
 
 
230 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.58086  normal  0.0811597 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4415  hypothetical protein  47.29 
 
 
230 aa  188  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0517535  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4578  hypothetical protein  47.29 
 
 
230 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.691286 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4504  hypothetical protein  47.29 
 
 
230 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0307529 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4382  hypothetical protein  47.29 
 
 
230 aa  187  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2651  putative lipoprotein  25.49 
 
 
231 aa  48.1  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00212  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.02 
 
 
232 aa  44.7  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>