23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4578 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A4578  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  477  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.691286 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4415  hypothetical protein  99.57 
 
 		 230 aa  474  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0517535  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4382  hypothetical protein  99.57 
 
 		 230 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4502  hypothetical protein  99.13 
 
 		 230 aa  474  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.58086  normal  0.0811597 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4504  hypothetical protein  99.57 
 
 		 230 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0307529 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4492  hypothetical protein  77.49 
 
 		 231 aa  377  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0791634  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03878  hypothetical protein  77.06 
 
 		 231 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.353029  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03831  hypothetical protein  77.06 
 
 		 231 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.477079  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4235  hypothetical protein  77.06 
 
 		 231 aa  375  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4544  hypothetical protein  77.06 
 
 		 231 aa  375  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.145263  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0214  hypothetical protein  76.96 
 
 		 232 aa  374  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0096485  normal  0.0118868 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3993  protein of unknown function DUF1481  78.67 
 
 		 211 aa  351  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4449  hypothetical protein  78.2 
 
 		 211 aa  349  2e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.32237  hitchhiker  0.00225378 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4024  hypothetical protein  78.2 
 
 		 211 aa  349  2e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.760823  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5470  hypothetical protein  77.73 
 
 		 211 aa  348  5e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.191236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0291  hypothetical protein  47.29 
 
 		 212 aa  189  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0030425  normal  0.0114039 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3845  putative lipoprotein  41.59 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0652074  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0355  hypothetical protein  41.94 
 
 		 217 aa  177  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0991625  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0223  hypothetical protein  39.3 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.543212  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0463  hypothetical protein  41.67 
 
 		 219 aa  176  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00842052  hitchhiker  0.00244821 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3863  protein of unknown function DUF1481  40.17 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.454596  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0227  protein of unknown function DUF1481  38.29 
 
 		 227 aa  170  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.143449  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3709  protein of unknown function DUF1481  39.61 
 
 		 210 aa  162  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0574933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>