23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3709 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3709  protein of unknown function DUF1481  100 
 
 
210 aa  429  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0574933  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3863  protein of unknown function DUF1481  67.8 
 
 
236 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.454596  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0291  hypothetical protein  54.93 
 
 
212 aa  235  4e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0030425  normal  0.0114039 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0223  hypothetical protein  53.17 
 
 
228 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.543212  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0227  protein of unknown function DUF1481  53.66 
 
 
227 aa  229  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.143449  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3845  putative lipoprotein  53.43 
 
 
233 aa  226  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0652074  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0463  hypothetical protein  53.43 
 
 
219 aa  226  3e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00842052  hitchhiker  0.00244821 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0355  hypothetical protein  53.43 
 
 
217 aa  226  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0991625  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4578  hypothetical protein  39.61 
 
 
230 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.691286 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4415  hypothetical protein  39.61 
 
 
230 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0517535  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4502  hypothetical protein  39.61 
 
 
230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.58086  normal  0.0811597 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4382  hypothetical protein  39.61 
 
 
230 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4504  hypothetical protein  39.13 
 
 
230 aa  161  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0307529 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0214  hypothetical protein  39.02 
 
 
232 aa  153  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0096485  normal  0.0118868 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3993  protein of unknown function DUF1481  39.9 
 
 
211 aa  151  8e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4492  hypothetical protein  39.9 
 
 
231 aa  150  8.999999999999999e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0791634  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4449  hypothetical protein  39.81 
 
 
211 aa  150  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.32237  hitchhiker  0.00225378 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4024  hypothetical protein  39.81 
 
 
211 aa  150  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.760823  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03831  hypothetical protein  39.81 
 
 
231 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.477079  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4544  hypothetical protein  39.81 
 
 
231 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.145263  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4235  hypothetical protein  39.81 
 
 
231 aa  150  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03878  hypothetical protein  39.81 
 
 
231 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.353029  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5470  hypothetical protein  39.32 
 
 
211 aa  149  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.191236  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>