15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1610 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1610  AbrB family transcriptional regulator  100 
 
 		 79 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00130858  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1308  AbrB family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 86 aa  50.8  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.491223  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0741  transcriptional regulator, AbrB family  44.68 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0216601  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0959  AbrB family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.538294  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2552  transcriptional regulator, AbrB family  51.16 
 
 		 86 aa  47.4  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1354  AbrB family transcriptional regulator  52.5 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2773  transcriptional regulator, AbrB family  56.41 
 
 		 91 aa  45.4  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1478  AbrB family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.249769  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0868  transcriptional regulator, AbrB family  52.5 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.300001  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1708  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  51.28 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.537768  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2441  transcriptional regulator, AbrB family  43.48 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.189768  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0370  AbrB family transcriptional regulator  60.53 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.210887  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0819  transcriptional regulator, AbrB family  45.24 
 
 		 73 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0118  transcriptional regulator, AbrB family  40.35 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2774  transcriptional regulator, AbrB family  46.34 
 
 		 78 aa  40.8  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>