17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1263 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1263  CRISPR-associated protein APE2256 family  100 
 
 		 253 aa  494  1e-139  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1342  CRISPR-associated protein APE2256 family  33.95 
 
 		 278 aa  122  6e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.330295  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1509  CRISPR-associated protein APE2256 family  29.69 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.113599  normal  0.470127 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1281  CRISPR-associated protein APE2256 family  35.71 
 
 		 268 aa  94.4  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0224948 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0445  CRISPR-associated APE2256 family protein  41.18 
 
 		 222 aa  93.2  4e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.866351  hitchhiker  0.0045527 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2271  CRISPR-associated protein, APE2256 family  27.78 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.452676  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0958  CRISPR-associated APE2256 family protein  37.17 
 
 		 346 aa  81.3  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.689392 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1513  CRISPR-associated protein APE2256 family  33.84 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00403065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3373  hypothetical protein  35.03 
 
 		 348 aa  74.3  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1109  CRISPR-associated protein APE2256 family  34.59 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000998852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0258  CRISPR-associated APE2256 family protein  28.24 
 
 		 373 aa  68.6  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1656  CRISPR-associated protein APE2256 family  27 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0169075  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1479  APE2256 family CRISPR-associated protein  27.53 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.394423 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5837  CRISPR-associated protein, APE2256 family  26.79 
 
 		 383 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0745  CRISPR-associated protein APE2256 family  27.98 
 
 		 368 aa  53.5  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15100  putative CRISPR-associated protein, APE2256 family  24 
 
 		 404 aa  43.9  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1446  hypothetical protein  27.33 
 
 		 335 aa  42  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282412 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>