14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3270 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3270  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  564  1e-160  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3712  hypothetical protein  48.21 
 
 		 294 aa  206  4e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.479438  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1394  hypothetical protein  40.98 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0587  hypothetical protein  38.6 
 
 		 274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1100  hypothetical protein  36.9 
 
 		 279 aa  139  6e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23020  hypothetical protein  29.9 
 
 		 295 aa  99.8  5e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3129  hypothetical protein  32.97 
 
 		 279 aa  97.1  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.975256  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3715  hypothetical protein  32.93 
 
 		 272 aa  95.9  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27160  hypothetical protein  33.21 
 
 		 323 aa  89  8e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2824  protein of unknown function DUF559  29.73 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0136609 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0966  hypothetical protein  27.68 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4159  hypothetical protein  31.41 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00219007  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5112  hypothetical protein  41.38 
 
 		 329 aa  47  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00146681 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0470  hypothetical protein  37.08 
 
 		 2045 aa  42.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>