13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0587 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0587  hypothetical protein  100 
 
 
274 aa  550  1e-156  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1100  hypothetical protein  55.72 
 
 
279 aa  285  4e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3270  hypothetical protein  38.24 
 
 
286 aa  150  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1394  hypothetical protein  35.23 
 
 
295 aa  140  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3712  hypothetical protein  35.07 
 
 
294 aa  126  5e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.479438  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27160  hypothetical protein  32.56 
 
 
323 aa  97.8  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3715  hypothetical protein  27.48 
 
 
272 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0966  hypothetical protein  27.41 
 
 
275 aa  78.6  0.00000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23020  hypothetical protein  28.26 
 
 
295 aa  78.2  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2824  protein of unknown function DUF559  25.66 
 
 
283 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0136609 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3129  hypothetical protein  24.81 
 
 
279 aa  59.3  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.975256  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4159  hypothetical protein  29.46 
 
 
276 aa  53.5  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00219007  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1071  hypothetical protein  28.97 
 
 
304 aa  43.9  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>