15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0748 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0748  membrane glycine and proline rich protein  100 
 
 
294 aa  576  1.0000000000000001e-163  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0747  putative membrane glycine and proline rich protein  50.85 
 
 
257 aa  204  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11118  glycine and proline rich membrane protein  34.14 
 
 
293 aa  103  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.673074 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3438  hypothetical protein  48.18 
 
 
188 aa  57.4  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67249  1,3-beta-D-glucan synthase subunit (BGS3) (GSC2)  39.77 
 
 
1889 aa  51.2  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.660291 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30140  hypothetical protein  27.62 
 
 
321 aa  49.3  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.874298  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5844  hypothetical protein  34.65 
 
 
362 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134237  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0938  hypothetical protein  52.56 
 
 
224 aa  47  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8906  hypothetical protein  34.25 
 
 
214 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0745  hypothetical protein  52.24 
 
 
164 aa  45.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21920  hypothetical protein  39.29 
 
 
207 aa  44.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0231222  normal  0.21627 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0079  protein of unknown function DUF1112  49.21 
 
 
310 aa  43.5  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.735437  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7608  glycosyl transferase family 2  52.31 
 
 
1299 aa  43.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0013  hypothetical protein  31.29 
 
 
184 aa  42.7  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.114755  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3746  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, membrane domain protein  45.65 
 
 
514 aa  42.7  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>