15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2782 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2782  hypothetical protein  100 
 
 
93 aa  188  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000931172  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0835  hypothetical protein  60.92 
 
 
91 aa  107  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.362102  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6342  antitoxin of a toxin/antitoxin system  59.34 
 
 
92 aa  92  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000639771  unclonable  0.0000000491006 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1478  hypothetical protein  59.34 
 
 
92 aa  92  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.690305  unclonable  0.0000000000000121771 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1853  hypothetical protein  59.34 
 
 
92 aa  92  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0573834  hitchhiker  0.000000000000313336 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4480  hypothetical protein  59.34 
 
 
92 aa  92  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000118504 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0844  hypothetical protein  61.18 
 
 
97 aa  91.7  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2110  hypothetical protein  59.55 
 
 
92 aa  88.6  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.419792  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2335  hypothetical protein  64.94 
 
 
92 aa  87.8  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3761  hypothetical protein  40 
 
 
96 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.224047 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4585  hypothetical protein  40.24 
 
 
89 aa  61.2  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0005  hypothetical protein  32.93 
 
 
89 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.301407  normal 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0045  hypothetical protein  31.71 
 
 
89 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.130777  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0255  hypothetical protein  32.53 
 
 
89 aa  51.6  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.50052  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3057  hypothetical protein  35.59 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.486462  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>