18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3761 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3761  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  186  7e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.224047 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0255  hypothetical protein  43.96 
 
 		 89 aa  77.4  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.50052  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0005  hypothetical protein  43.96 
 
 		 89 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.301407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0045  hypothetical protein  42.86 
 
 		 89 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.130777  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2782  hypothetical protein  42.35 
 
 		 93 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000931172  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4585  hypothetical protein  48.81 
 
 		 89 aa  69.7  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0844  hypothetical protein  40.43 
 
 		 97 aa  67.4  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4480  hypothetical protein  45.78 
 
 		 92 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000118504 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1853  hypothetical protein  45.78 
 
 		 92 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0573834  hitchhiker  0.000000000000313336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1478  hypothetical protein  45.78 
 
 		 92 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.690305  unclonable  0.0000000000000121771 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6342  antitoxin of a toxin/antitoxin system  45.78 
 
 		 92 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000639771  unclonable  0.0000000491006 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2110  hypothetical protein  42.05 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.419792  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0835  hypothetical protein  37.8 
 
 		 91 aa  57  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.362102  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4227  hypothetical protein  67.57 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.517904  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0977  hypothetical protein  51.16 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2904  CopG family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 94 aa  47  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000144196  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2335  hypothetical protein  36.49 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0742  CopG family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 122 aa  40.4  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.716439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>