20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4585 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_4585  hypothetical protein  100 
 
 
89 aa  176  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3761  hypothetical protein  49.3 
 
 
96 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.224047 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2782  hypothetical protein  40.24 
 
 
93 aa  72.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000931172  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0835  hypothetical protein  39.02 
 
 
91 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.362102  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0005  hypothetical protein  39.33 
 
 
89 aa  62.8  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.301407  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0255  hypothetical protein  38.2 
 
 
89 aa  60.5  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.50052  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0045  hypothetical protein  37.08 
 
 
89 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.130777  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4480  hypothetical protein  42.35 
 
 
92 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000118504 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6342  antitoxin of a toxin/antitoxin system  42.35 
 
 
92 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000639771  unclonable  0.0000000491006 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1853  hypothetical protein  42.35 
 
 
92 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0573834  hitchhiker  0.000000000000313336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1478  hypothetical protein  42.35 
 
 
92 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.690305  unclonable  0.0000000000000121771 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0844  hypothetical protein  46.03 
 
 
97 aa  57  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2110  hypothetical protein  40 
 
 
92 aa  56.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.419792  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2335  hypothetical protein  42.86 
 
 
92 aa  53.9  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2904  CopG family transcriptional regulator  47.83 
 
 
94 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000144196  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4227  hypothetical protein  48.84 
 
 
100 aa  43.9  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.517904  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03468  transcriptional regulator, CopG family  31.82 
 
 
82 aa  43.9  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0977  hypothetical protein  50 
 
 
100 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3057  hypothetical protein  45.24 
 
 
92 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.486462  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1809  hypothetical protein  46.34 
 
 
67 aa  40.8  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.535263  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>