16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2110 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2110  hypothetical protein  100 
 
 
92 aa  178  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.419792  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6342  antitoxin of a toxin/antitoxin system  94.57 
 
 
92 aa  149  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000639771  unclonable  0.0000000491006 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1478  hypothetical protein  94.57 
 
 
92 aa  149  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.690305  unclonable  0.0000000000000121771 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1853  hypothetical protein  94.57 
 
 
92 aa  149  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0573834  hitchhiker  0.000000000000313336 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4480  hypothetical protein  94.57 
 
 
92 aa  149  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000118504 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0835  hypothetical protein  72.83 
 
 
91 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.362102  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0844  hypothetical protein  65.22 
 
 
97 aa  108  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2782  hypothetical protein  59.55 
 
 
93 aa  105  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000931172  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2335  hypothetical protein  74.03 
 
 
92 aa  98.6  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3761  hypothetical protein  39.39 
 
 
96 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.224047 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4585  hypothetical protein  40 
 
 
89 aa  56.2  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0005  hypothetical protein  31.82 
 
 
89 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.301407  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0255  hypothetical protein  30.68 
 
 
89 aa  49.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.50052  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0045  hypothetical protein  29.55 
 
 
89 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.130777  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1495  hypothetical protein  37.5 
 
 
60 aa  44.3  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.793721  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4227  hypothetical protein  45 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.517904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>