35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0644 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0644  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  217  5e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2249  Uncharacterized conserved protein UCP019302  51.55 
 
 
105 aa  111  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.20884 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2095  hypothetical protein  52.48 
 
 
104 aa  110  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.145092 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0006  hypothetical protein  48.04 
 
 
104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000274922 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1660  hypothetical protein  51.49 
 
 
104 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.313201  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2295  hypothetical protein  50.5 
 
 
108 aa  100  8e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.996082  hitchhiker  0.00747004 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5142  hypothetical protein  53.33 
 
 
110 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.660173  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2893  hypothetical protein  47.06 
 
 
121 aa  99  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4805  hypothetical protein  51.69 
 
 
121 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00176648  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3362  hypothetical protein  51.69 
 
 
121 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133747  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3298  hypothetical protein  52.81 
 
 
110 aa  97.8  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0225691 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3411  hypothetical protein  48.51 
 
 
105 aa  97.4  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.623644  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5227  hypothetical protein  51.65 
 
 
110 aa  97.1  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0280067  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4153  hypothetical protein  51.69 
 
 
110 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.928089  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0382  hypothetical protein  47.52 
 
 
103 aa  95.9  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0012247  normal  0.207267 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4363  hypothetical protein  53.41 
 
 
135 aa  95.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0113  hypothetical protein  53.41 
 
 
110 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.488276  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1282  hypothetical protein  53.41 
 
 
110 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1699  hypothetical protein  53.41 
 
 
110 aa  94.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.703501  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1785  hypothetical protein  53.41 
 
 
110 aa  94.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0313  hypothetical protein  53.41 
 
 
110 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0263  hypothetical protein  53.41 
 
 
110 aa  94.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1112  hypothetical protein  53.41 
 
 
110 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413231  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1151  hypothetical protein  53.41 
 
 
110 aa  92.8  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.128538  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5832  hypothetical protein  52.27 
 
 
113 aa  92  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526141  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3320  hypothetical protein  47.06 
 
 
114 aa  91.3  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03757  hypothetical protein  48.51 
 
 
110 aa  89.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2487  hypothetical protein  51.14 
 
 
109 aa  89.4  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.582514 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3286  hypothetical protein  48.31 
 
 
105 aa  88.2  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4608  hypothetical protein  51.14 
 
 
110 aa  87.4  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4836  hypothetical protein  50 
 
 
110 aa  87  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3759  hypothetical protein  50 
 
 
110 aa  87  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0906  hypothetical protein  48.86 
 
 
110 aa  84  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0443  hypothetical protein  40.45 
 
 
101 aa  68.2  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.796217 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1544  hypothetical protein  38.83 
 
 
104 aa  68.2  0.00000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.5155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>