35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4153 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4153  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  220  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.928089  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3298  hypothetical protein  95.45 
 
 
110 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0225691 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2893  hypothetical protein  96.36 
 
 
121 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5227  hypothetical protein  95.45 
 
 
110 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0280067  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5142  hypothetical protein  95.41 
 
 
110 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.660173  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3362  hypothetical protein  95.41 
 
 
121 aa  209  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133747  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4805  hypothetical protein  95.41 
 
 
121 aa  209  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00176648  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1112  hypothetical protein  86.36 
 
 
110 aa  192  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413231  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1282  hypothetical protein  86.36 
 
 
110 aa  192  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1699  hypothetical protein  86.36 
 
 
110 aa  192  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.703501  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1785  hypothetical protein  86.36 
 
 
110 aa  192  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0313  hypothetical protein  86.36 
 
 
110 aa  192  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0113  hypothetical protein  86.36 
 
 
110 aa  192  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.488276  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0263  hypothetical protein  86.36 
 
 
110 aa  192  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1151  hypothetical protein  85.45 
 
 
110 aa  191  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.128538  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3759  hypothetical protein  83.64 
 
 
110 aa  187  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4836  hypothetical protein  83.64 
 
 
110 aa  187  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03757  hypothetical protein  84.4 
 
 
110 aa  186  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4363  hypothetical protein  82.57 
 
 
135 aa  186  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5832  hypothetical protein  82.41 
 
 
113 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526141  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0906  hypothetical protein  81.82 
 
 
110 aa  179  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4608  hypothetical protein  80.91 
 
 
110 aa  178  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3320  hypothetical protein  71.7 
 
 
114 aa  152  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3286  hypothetical protein  53.61 
 
 
105 aa  111  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3411  hypothetical protein  51 
 
 
105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.623644  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2095  hypothetical protein  52.48 
 
 
104 aa  106  9.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.145092 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1660  hypothetical protein  51.49 
 
 
104 aa  103  8e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.313201  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2487  hypothetical protein  50 
 
 
109 aa  97.8  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.582514 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0644  hypothetical protein  51.69 
 
 
106 aa  97.1  8e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0382  hypothetical protein  47 
 
 
103 aa  95.1  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0012247  normal  0.207267 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0006  hypothetical protein  50.55 
 
 
104 aa  92.8  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000274922 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2295  hypothetical protein  45.54 
 
 
108 aa  91.3  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.996082  hitchhiker  0.00747004 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0443  hypothetical protein  51.09 
 
 
101 aa  85.9  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.796217 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1544  hypothetical protein  45.56 
 
 
104 aa  77  0.00000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.5155  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2249  Uncharacterized conserved protein UCP019302  39.58 
 
 
105 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.20884 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>