35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3759 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3759  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  219  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4836  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  219  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1151  hypothetical protein  86.36 
 
 		 110 aa  193  7e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.128538  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03757  hypothetical protein  85.32 
 
 		 110 aa  191  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1112  hypothetical protein  85.45 
 
 		 110 aa  189  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413231  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1282  hypothetical protein  85.45 
 
 		 110 aa  189  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1699  hypothetical protein  85.45 
 
 		 110 aa  189  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.703501  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1785  hypothetical protein  85.45 
 
 		 110 aa  189  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0313  hypothetical protein  85.45 
 
 		 110 aa  189  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0113  hypothetical protein  85.45 
 
 		 110 aa  189  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.488276  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0263  hypothetical protein  85.45 
 
 		 110 aa  189  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4153  hypothetical protein  83.64 
 
 		 110 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.928089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4363  hypothetical protein  81.65 
 
 		 135 aa  184  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3298  hypothetical protein  81.82 
 
 		 110 aa  183  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0225691 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5832  hypothetical protein  83.33 
 
 		 113 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5227  hypothetical protein  80.91 
 
 		 110 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0280067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5142  hypothetical protein  81.65 
 
 		 110 aa  178  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.660173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2893  hypothetical protein  80 
 
 		 121 aa  178  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4805  hypothetical protein  80.73 
 
 		 121 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00176648  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3362  hypothetical protein  80.73 
 
 		 121 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4608  hypothetical protein  78.18 
 
 		 110 aa  175  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0906  hypothetical protein  78.18 
 
 		 110 aa  174  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3320  hypothetical protein  66.98 
 
 		 114 aa  144  6e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3286  hypothetical protein  54.64 
 
 		 105 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3411  hypothetical protein  49.48 
 
 		 105 aa  103  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.623644  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2095  hypothetical protein  49.5 
 
 		 104 aa  100  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.145092 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2487  hypothetical protein  50 
 
 		 109 aa  97.8  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582514 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0382  hypothetical protein  46 
 
 		 103 aa  97.4  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0012247  normal  0.207267 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1660  hypothetical protein  48.51 
 
 		 104 aa  96.7  9e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.313201  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0006  hypothetical protein  44.55 
 
 		 104 aa  89.4  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000274922 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0443  hypothetical protein  53.41 
 
 		 101 aa  88.6  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.796217 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2295  hypothetical protein  45.54 
 
 		 108 aa  89  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.996082  hitchhiker  0.00747004 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0644  hypothetical protein  50 
 
 		 106 aa  87  9e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1544  hypothetical protein  42.7 
 
 		 104 aa  70.5  0.000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.5155  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2249  Uncharacterized conserved protein UCP019302  35.79 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.20884 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>