35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0006 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0006  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  205  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000274922 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2095  hypothetical protein  66.35 
 
 		 104 aa  137  7e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.145092 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3411  hypothetical protein  66 
 
 		 105 aa  135  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.623644  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1660  hypothetical protein  65.38 
 
 		 104 aa  134  4e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.313201  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2295  hypothetical protein  62.86 
 
 		 108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.996082  hitchhiker  0.00747004 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2487  hypothetical protein  61.9 
 
 		 109 aa  122  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582514 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0644  hypothetical protein  48.04 
 
 		 106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3286  hypothetical protein  54.55 
 
 		 105 aa  107  8.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0382  hypothetical protein  48 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0012247  normal  0.207267 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0443  hypothetical protein  50 
 
 		 101 aa  96.3  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.796217 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4363  hypothetical protein  45.54 
 
 		 135 aa  94  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4153  hypothetical protein  50.55 
 
 		 110 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.928089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5227  hypothetical protein  49.45 
 
 		 110 aa  91.7  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0280067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4805  hypothetical protein  50 
 
 		 121 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00176648  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3298  hypothetical protein  48.89 
 
 		 110 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0225691 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3362  hypothetical protein  50 
 
 		 121 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2893  hypothetical protein  50 
 
 		 121 aa  91.3  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5832  hypothetical protein  43.69 
 
 		 113 aa  90.9  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5142  hypothetical protein  48.89 
 
 		 110 aa  90.5  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.660173  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03757  hypothetical protein  44.55 
 
 		 110 aa  90.1  9e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1112  hypothetical protein  43.56 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413231  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4608  hypothetical protein  43.69 
 
 		 110 aa  90.1  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1282  hypothetical protein  43.56 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1699  hypothetical protein  43.56 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.703501  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1785  hypothetical protein  43.56 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0313  hypothetical protein  43.56 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0113  hypothetical protein  43.56 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.488276  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0263  hypothetical protein  43.56 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4836  hypothetical protein  44.55 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3759  hypothetical protein  44.55 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0906  hypothetical protein  41.75 
 
 		 110 aa  87.8  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1151  hypothetical protein  45.65 
 
 		 110 aa  87.8  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.128538  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1544  hypothetical protein  44 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.5155  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2249  Uncharacterized conserved protein UCP019302  42.71 
 
 		 105 aa  81.3  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.20884 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3320  hypothetical protein  40.78 
 
 		 114 aa  80.1  0.000000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>