17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4575 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4575  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  295  1e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3663  hypothetical protein  32.81 
 
 
245 aa  68.2  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00163661  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1346  hypothetical protein  33.65 
 
 
201 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1255  hypothetical protein  33.65 
 
 
201 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339112  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1709  hypothetical protein  36.25 
 
 
209 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.252813  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34902  predicted protein  30.77 
 
 
291 aa  55.1  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47175  predicted protein  27.68 
 
 
369 aa  53.1  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47174  predicted protein  27.1 
 
 
299 aa  49.7  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1028  O-methyltransferase family protein  37.5 
 
 
258 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0113  hypothetical protein  25.41 
 
 
260 aa  44.3  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.119878  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0368  hypothetical protein  39.53 
 
 
216 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.810453  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0347  hypothetical protein  39.53 
 
 
216 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.834243 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0358  hypothetical protein  39.53 
 
 
216 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2599  glycosyl transferase group 1  30.93 
 
 
956 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1461  hypothetical protein  39.39 
 
 
305 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3358  hypothetical protein  32.39 
 
 
261 aa  40.8  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6507  O-methyltransferase-like protein  30.36 
 
 
263 aa  40  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00174248  normal  0.189138 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>