14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1836 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1836  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  100 
 
 
234 aa  482  1e-135  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.764837  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2544  peptidase metallopeptidase  56.92 
 
 
264 aa  222  3e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.315582  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0725  peptidase, metallopeptidase  50.67 
 
 
254 aa  220  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.364392  normal  0.750618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4038  hypothetical protein  51.79 
 
 
257 aa  198  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00794485 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2212  hypothetical protein  49.76 
 
 
263 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000676679 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2313  peptidase metallopeptidase  49.24 
 
 
268 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.375017 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2262  peptidase metallopeptidase  48.48 
 
 
268 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0467  peptidase, metallopeptidase  38.38 
 
 
277 aa  108  5e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0907  peptidase, metallopeptidase  34.39 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.20081  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1002  hypothetical protein  35.21 
 
 
221 aa  73.2  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.222918  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18281  hypothetical protein  47.06 
 
 
73 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.136589 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0820  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  35.82 
 
 
244 aa  44.7  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.101755 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0699  hypothetical protein  29.49 
 
 
229 aa  43.5  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.759494 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0706  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  40.82 
 
 
336 aa  42.7  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>