17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1789 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1789  hypothetical protein  100 
 
 
66 aa  135  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4574  hypothetical protein  66.67 
 
 
201 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493342  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1592  hypothetical protein  65.96 
 
 
198 aa  65.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1983  hypothetical protein  55.32 
 
 
198 aa  59.3  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.428764  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2847  hypothetical protein  55.32 
 
 
205 aa  58.9  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2929  hypothetical protein  56.86 
 
 
208 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1959  hypothetical protein  56.86 
 
 
207 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95171  normal 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5292  hypothetical protein  59.57 
 
 
206 aa  57.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3292  hypothetical protein  56.25 
 
 
164 aa  57  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.948121  decreased coverage  0.00586872 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2757  hypothetical protein  54.17 
 
 
200 aa  53.9  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.088945  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0805  hypothetical protein  51.92 
 
 
99 aa  53.9  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0646  hypothetical protein  51.06 
 
 
205 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0666  hypothetical protein  51.06 
 
 
205 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.494626 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2919  hypothetical protein  47.92 
 
 
202 aa  49.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.246564 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1907  hypothetical protein  39.58 
 
 
204 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000033227 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2967  hypothetical protein  61.29 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.586657  normal  0.086374 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4422  hypothetical protein  48.94 
 
 
212 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.267194 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>