22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1959 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1959  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  424  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95171  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2929  hypothetical protein  83.84 
 
 
208 aa  353  1e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2847  hypothetical protein  51.53 
 
 
205 aa  211  7.999999999999999e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0666  hypothetical protein  50.75 
 
 
205 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.494626 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1983  hypothetical protein  48.99 
 
 
198 aa  202  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.428764  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2757  hypothetical protein  51.3 
 
 
200 aa  203  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.088945  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0646  hypothetical protein  50.75 
 
 
205 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1592  hypothetical protein  48.72 
 
 
198 aa  196  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5292  hypothetical protein  47.69 
 
 
206 aa  168  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4574  hypothetical protein  45.41 
 
 
201 aa  168  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493342  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3292  hypothetical protein  45.62 
 
 
164 aa  142  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.948121  decreased coverage  0.00586872 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2967  hypothetical protein  46.31 
 
 
151 aa  142  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.586657  normal  0.086374 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0805  hypothetical protein  55.13 
 
 
99 aa  94  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2919  hypothetical protein  33.1 
 
 
202 aa  71.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.246564 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1789  hypothetical protein  56.86 
 
 
66 aa  58.5  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1907  hypothetical protein  25.15 
 
 
204 aa  58.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000033227 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3023  hypothetical protein  46.97 
 
 
67 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0819  hypothetical protein  30.72 
 
 
205 aa  53.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.743694  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4453  hypothetical protein  26.95 
 
 
203 aa  52.4  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.133427  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1342  hypothetical protein  32.47 
 
 
203 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4422  hypothetical protein  31.13 
 
 
212 aa  51.6  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.267194 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0220  hypothetical protein  27.56 
 
 
204 aa  50.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0149567  hitchhiker  0.00492185 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>