22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2929 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2929  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  425  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1959  hypothetical protein  83.84 
 
 		 207 aa  353  1e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2847  hypothetical protein  51.55 
 
 		 205 aa  211  9e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2757  hypothetical protein  52.33 
 
 		 200 aa  210  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.088945  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1983  hypothetical protein  48.98 
 
 		 198 aa  202  3e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.428764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0666  hypothetical protein  49.74 
 
 		 205 aa  201  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.494626 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0646  hypothetical protein  49.74 
 
 		 205 aa  201  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1592  hypothetical protein  48.72 
 
 		 198 aa  201  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4574  hypothetical protein  48.48 
 
 		 201 aa  178  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5292  hypothetical protein  46.94 
 
 		 206 aa  171  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3292  hypothetical protein  51.55 
 
 		 164 aa  156  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.948121  decreased coverage  0.00586872 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2967  hypothetical protein  44.97 
 
 		 151 aa  144  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.586657  normal  0.086374 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0805  hypothetical protein  56 
 
 		 99 aa  92.4  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2919  hypothetical protein  27.55 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.246564 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3023  hypothetical protein  56.06 
 
 		 67 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0819  hypothetical protein  30.21 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.743694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1907  hypothetical protein  24.49 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000033227 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1789  hypothetical protein  56.86 
 
 		 66 aa  58.5  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0220  hypothetical protein  27.59 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0149567  hitchhiker  0.00492185 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4422  hypothetical protein  34 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.267194 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4453  hypothetical protein  28.8 
 
 		 203 aa  51.6  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.133427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1342  hypothetical protein  25 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>